Этот монастырь основан в середине 18 века на месте, где жил и медитировал великий святой Лама Цонкапа. Там же росло большое сандаловое дерево с тысячью листьями. Поэтому основанный на этой территории монастырь и был назван Кумбум, что значит тысяча ступ. Раньше в Кумубм Гомпе насчитывалось 2000 монахов. При монастыре был организован крупный медицинский факультет или манжи-дацан, где изучали и практиковали тибетскую медицину и астрологию. Возглавлял факультет хамбо или декан.
Обучение этому искусству – процесс длительный. Восемь лет требуется для завершения курса, состоящего из изучения основных медицинских трактатов, а также учебников по буддийской философии. В течение первых лет студенты помогают своим учителям в сборе растений и приготовлении лекарств. В начале лета предпринимаются экскурсии в окрестные горы для сбора растений, которые затем высушиваются и измельчаются. Параллельно с этими практическими занятиями фармакологией студенты изучают учебники, такие как "Чжуд Ши", "Лхантаб". Ламы-врачи никогда сразу не передают всех знанию своим студентам. У одного ламы может быть несколько учеников и каждому из них он дает лишь часть сведений о различных лекарствах и методах лечения. Так учителя испытывают учеников и их устремленность к знаниях. Только через несколько лет пребывания с учителем ученики получают знание фармакологии.
